Впрочем, фобия сибирского сепаратизма появилась раньше, чем в самой Сибири начали формироваться автономистские настроения и зародилось сибирское областничество. Уже в первой половине XIX в. появляются в правительственных кругах сомнения в благонадежности сибиряков, предчувствие, что Сибирь может последовать примеру североамериканских колоний. Опасались как происков разного рода недоброжелателей России, так и распространения на Сибирь через политических ссыльных революционного духа. В правительстве рано начинают задумываться над перспективой сибирского сепаратизма.