Прославленный как спаситель японского полицейского департамента, детектив средней школы Шиничи Кудоу использует сочетание наблюдательности, критического мышления и всесторонних знаний для раскрытия дел, которые ставят полицию в тупик.Однажды, находясь на прогулке с другом детства Раном Моури, Шиничи становится свидетелем подозрительной сделки между двумя мужчинами и оказывается пойманным. В результате его заставляют выпить яд, который должен был убить его, но неожиданно уменьшил его тело до размеров школьника. Считая себя мертвым, Шиничи берет псевдоним Конан Эдогава (соединение имен знаменитых авторов загадок Артура Конан Дойла и Ранпо Эдогавы), чтобы скрыть свою личность, и начинает новую жизнь в качестве семилетнего ребенка, живущего с Ран и ее отцом частным детективом.Мейтантэй Конан следует за Конаном, продолжая раскрывать дела об убийствах, и одновременно пытается разоблачить тех, кто уменьшил его, и в конце концов восстановить его тело.
